源资科技暑期网络专题讲座

专题一: ACD/labs在新药研发中的应用

报告人: 源资科技分析化学软件高级技术支持 马东杰 先生
时间: 2011年7月5日 10:00~12:00
摘要:
    ACD/Labs（高级化学发展有限公司Advanced   Chemistry Development）是目前唯一一款真正将化学结构，化合物性质，仪器分析数据，专家辅助系统有机结合的化学分析数据的综合管理系统。  ACD/labs可以帮助您在同一界面下实现以化合物结构为中心的不同型号的仪器分析数据的处理，分析和管理，以及基于大量实验事实数据的化合物性质预测；同时，还提供了丰富的专家辅助系统。 ACD/Labs的高级功能涵盖了化合物的谱图预测、理化性质，药代动力学性质和毒性预测、未知化合物的结构解析、色谱分离方法优化，质谱裂解途径分析，分子设计和用户数据库的构建等。报告将着重介绍ACD/labs的仪器分析数据的综合管理系统，药代动力学和毒性预测系统以及这些模块在新药研发中的应用。

专题二: 基于数据分析的实验室解决方案

报告人: 源资科技分析化学软件高级技术支持 张赛丹 女士
时间: 2011年7月8日 10:00~12:00
摘要:
    高级化学发展有限公司Advanced Chemistry Development（以下简称ACD/Labs）是一家将化学结构与分析化学信息进行有效结合、进而产生全面分析化学管理系统（英文简称ChemAnalytics）的化学软件公司。本着不断创新的精神陆续推出多种化学软件包，帮助世界范围内的化学科研人员解决不同的科研难题，且具有强大的资料整合能力，支持各种流行分析仪器的数据。ACD/Labs功能主要包括未知化学物质结构解析、谱图预测和解释、分析数据处理与管理、分子设计理化性质和药物代谢毒性预测、色谱分离、医药化学、新药试剂合成、化学系统命名、以及化学专利和论文的发表。

专题三: 网络生物学及其在药物分子作用机理研究中的应用

报告人: 源资科技系统生物学软件高级技术支持 林玲 博士
时间: 2011年7月13日 14:00~16:00
摘要:
    随着生物科技和信息技术的创新发展，人们对生命活动的分子机制研究逐步深入，研究焦点已从单个分子转向分子间相互关系及其所构成的复杂网络上（包括代谢网络、基因调控网络和信号转导网络等）。网络生物学与网络药理学在此基础上应运而生，为复杂疾病研究提供了新思路，并被用于药物靶标的发现。本讲座主要介绍以下几方面内容：网络生物学及网络药理学的基本概念和研究方法，基于网络生物学理论的生物医药领域研究工具metacore/metadrug功能简介，metadrug在药物研发领域应用实例介绍及基本操作演示。
 

专题四: 高通量数据发现管理平台Genedata简介及在药物研发中的应用

报告人: 源资科技系统生物学软件高级技术支持 林玲 博士
时间: 2011年7月15日 14:00~16:00
摘要:
    高通量筛选以其快速、高效的技术优势在创新药物发现研究中起着越来越重要的作用。然而长期以来，如何有效的分析处理高通量产生的庞大数据一直是制约高通量技术发展的关键因素之一。因此开发专业的数据处理平台有助于提高高通量筛选的效率，加快药物研发的进程。本讲座主要介绍以下几方面内容：生物医药领域高通量数据处理现状；Genedata产品模块及功能简介：Screener(先导数据发现及管理)，Expressionist（MS,芯片，二代测序数据分析），Analyst；Genedata与genego产品metacore在药物研发中的应用。

专题五: Chemaxon 作为可视化工具在日常专业工作中的应用

报告人: 源资科技分析化学软件高级技术支持 张赛丹 女士
时间: 2011年7月20日 10:00~12:00
摘要:
    Chemaxon不仅提供了一个有效的化学编辑器和展示工具，同时还配有以插件方式实现的属性预测功能。作为一个可视化工具，Chemaxon不仅能提供所有重要特性，而且还包括其他可视化工具所缺少的某些功能，特别是：基于网络浏览器的高质量渲染；管理特别大的复合体；可实现一般分子的表面类型；映射分子特性到表面；交互式显示和控制；平台无关；可作为程序员工具箱（Java API）等。

专题六: GAUSSIAN 09及其新功能

报告人: 源资科技Gaussian软件高级技术支持 吴艳波 博士
时间: 2011年7月22日 10:00~12:00
摘要:
    为了满足广大科研工作者对Gaussian软件在电子结构计算领域中的应用，及其新功能的全面了解。源资科技特地运用网络资源，为您讲解和分析Gaussian软件重要的最新应用成果以及在相关领域中的应用。让您足不出户即可完整全面地了解Gaussian09新功能和应用实例。     源资科技作为Gaussian软件在中国和香港地区独家代理商，一直致力于为广大Gaussian用户提供一个广泛的交流平台，通过与用户的交流，能更深入的了解到广大用户的科研需要，同时将最新的研究应用成果及时地提供给广大用户。

专题七: Pharsight为临床（前）研究提供各种解决方案-WinNonlin专讲

报告人: 源资科技Pharsight软件高级技术支持 曹晓芳 女士
时间: 2011年7月26日 10:00~12:00
摘要:
    新药开发的瓶颈，不仅来自日益增长的研究费用，而更多来自药物的有效性和安全性。如何尽早地确定药物的有效性和安全性呢？FDA的药代/药效科学家们提出了基于药物的模型研究。即在研发早期就充分利用PK/PD模型进行模拟，预测，实现早决策、低风险，达到降低研发费用及缩短研发周期的目的。那么FDA认可的数据平台是如何进行PK/PD模拟呢？又是如何生成符合法规要求的PK/PD报告内容呢？同时又是如何利用快速积累的数据和结果帮助药物研发者即时的做出决策呢？……此讲将为您全面介绍这些问题。

 
专题八: 毒理学发展新方向—计算毒理学与系统毒理学技术的概述与应用

报告人: 源资科技毒理学软件高级技术支持 邱燕 女士
时间: 2011年7月29日 10:00~12:00
摘要:
    随着系统生物组学和高通量分子检测技术的发展,新发现、新合成的化合物越来越多。传统的毒性评价实验已经不能满足新化合物研发的需求,因此,建立符合“4R”原则的体外毒性高通量筛选方法（计算毒理学）已成为毒理学方法学研究的一个重要发展趋势之一；通过整合包括定量构效关系在内不同层次的信息，系统研究毒性产生的作用机制，从而从分子水平完善毒理学领域的研究。本讲座的主要内容：（1）毒理学安全性评价传统方法与高新技术应用（2）与FDA合作开发，作为行业标准的计算毒理学平台Case Ultra及其应用（3）系统毒理学和计算毒理学整合预测平台ToxHunter及其应用（3）基于专家系统，含自建个性化模型的毒性预测软件Tox Suite及其应用

 
专题九: WinNonlin软件网络介绍

报告人: 源资科技Pharsight软件高级技术支持 曹晓芳 女士
时间: 2011年8月5日 10:00~12:00
摘要:
    WinNonlin软件是全球知名药代、药动软件开发商及服务供应商美国Pharsight公司开发。软件创始于1984年，FDA在1998年开始使用推广，是目前国外应用最广的药代、药动学研究分析软件，被业界专家评价为非房室模型分析和房室模型分析的行业标准。经过数十位专家二十多年的努力，WinNonlin软件在2010年6月发布了最新版本Phoenix WinNonlin。新版本一发布，就引起了工业界的强烈好评。新版本中强大的Workflow机制的引入，彻底改变了之前版本同时存在多个分析结果窗口间无线索、无法追溯、无法保存的局面；详细的计算、分析同步记录便于研究SOP管理；Workflow机制下衍生的模板功能，使得分析大量的样本量数据的计算效率提高了数十倍，同时降低了分析过程的错误率；良好的第三方软件的兼容性，譬如常用的SAS、NONMEM、S-Plus/R、Microsoft office软件，极大的满足了不同用户计算不同结果时的不同需求；强大的用户自定义模型功能更将模拟仿真变得异常简单、易得。不论你是药代、药动模型建立分析专家还是初学者，你都可以借助简单易学的图形界面和程序语言界面轻松拟合出不同药物在生物体内不同的ADME规律模型。

 
专题十: 最优秀的分子对接工具—Surflex-Dock介绍

报告人: 源资科技分子模拟软件技术支持 周敏 先生
时间: 2011年8月10日 10:00~12:00
摘要: 
    Surflex-Dock集速度、准确度和可用性于一身，采用一个随着阴性训练集化合物的增加而不断升级、参数化的经验打分函数和一个依赖基于表面的分子相似性方法的搜索引擎，其高通量虚拟筛选的阳性富集率是独一无二的。
    Surflex-Dock 是一个蛋白与配体的对接程序，在计算机筛选应用领域跟其它方法相比更快、更精确，从非作用配体中识别出真实作用配体的能力要高出5~10倍。该对接搜索引擎已成为专利技术。

 
专题十一: 新一代3D-QSAR模型—Topomer CoMFA与虚拟筛选工具Topomer Search介绍

报告人: 源资科技分子模拟软件技术支持 周敏 先生
时间: 2011年8月17日 10:00~12:00
摘要:
    Topomer CoMFA®是一个能够自动生成3D-QSAR模型并且可以预测化合物生物活性或性质的工具。Topomer CoMFA模型可以在几分钟内完成而不是几天，不管是QSAR 的专家还是QSAR的新手都能够很容易地进行操作，并且结果都可以与传统的CoMFA分析进行比较。
    Topomer Search是一个特殊快速的基于3D配体的虚拟筛选工具，已被证明为可高效地应用于先导优化和骨架跃迁。Topomer Search在单个进程上一昼夜就可以筛选数百万个结构，这就允许你可以筛选非常大的化合物数据库并且能够避免遗漏重要先导化合物的风险。此外，它还采用构象的独立topomer相似性进行完整分子、侧链或骨架的筛选。

专题十二: 虚拟筛选技术与新药先导结构的发现

报告人: 源资科技技术总监 范峰 博士
时间: 2011年8月26日 10:00~12:00
摘要:
    虚拟筛选是针对重要疾病特定靶标生物大分子的三维结构或定量构效关系(QSAR)模型，从现有小分子数据库中，搜寻与靶标生物大分子结合或符合QSAR模型的化合物，进行实验筛选研究。其目的是从几十到上百万个分子中，发现有潜在可能性的化合物，集中目标，大大降低实验筛选化合物数量，缩短研究周期，节约研究经费。
    虚拟筛选方法主要分为基于配体小分子的虚拟筛选(ligand-basedvirtual screening，LBVS)和基于受体生物大分子结构的虚拟筛选(structure-based virtual screening，SBVS)两种。

 
专题十三: Surflex-Sim-用分子表面形状相似性进行药物设计

报告人: 源资科技技术顾问 肖高铿 先生
时间: 2011年8月31日 10:00~12:00
摘要:
    分子相似性在药物发现中应用广泛，比如先导物发现、骨架替换、脱靶预测、先导物优化。很多时候、基于配体的预测性建模方法比分子对接方法更加有用，因为很多时候小分子生物学数据（从特异性的生化测试到整体器官水平的实验）要比高分辨的晶体结构数据要多的多，比如以GPCR受体为靶点的数据。Surflex-Sim是用一种独特的相似性方法比较分子之间的表面形状并对之排序、同时自动的进行构象搜寻与分子叠合。本在线报告为大家介绍Surflex-sim基本原理、应用及其性能，包括先导物发现、骨架替换、脱靶效应以及先导物优化的案例。

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